Borrelia infecties kunnen niet volledig worden uitgesloten bij negatieve serologische testen:

• "ELISA positieve of twijfelachtige resultaten werden waargenomen bij slechts 24 patiënten (53,3%)." (Wojciechowska-Koszko et al, februari 2011)
• "bij 32 patiënten werden specifieke antiborrelia antilichamen bevestigd door de westernblot ondanks een negatieve ELISA ... Bij patiënten met aanhoudende klachten is het noodzakelijk de westernblot test te gebruiken ..." Dit komt waarschijnlijk door de zeer lage productie van antilichamen dat veroorzaakt wordt door een immuunsysteem deficientie. (Durovska et al., 2010)
• "Het aantal IgM- en / of IgG-positieve ELISA resultaten ... varieerde van 34% tot 59% ... Vergelijking van immunoblots leverde grote verschillen in inter-test agreements ... Opmerkelijk, sommige immunoblots gaven positieve resultaten in monsters die negatief waren getest met alle acht ELISA’s.” (CW Ang et al., januari 2011)

Laboratoria zouden moet testen op "VIsE" bij de ELISA en immunoblot testsystemen. VlsE beschrijft het vermogen van de 'kameleon' Borrelia burgdorferi om voortdurend zijn oppervlak eiwitstructuur VlsE in vivo te veranderen om te voorkomen dat die door het immuunsysteem zou worden herkend. VlsE heeft de hoogste gevoeligheid bij het zoeken naar antistoffen tegen Borrelia burgdorferi.

De SeraSpot MicroArray analyseert Borrelia burgdorferi IgG- en IgM-antilichamen en Borrelia burgdorferi substammen:
VlsE (Borrelia burgdorferi afzelii), p39 (B.b. afzelii), p58 (B.b. garinii), p100 (B.b. afzelii), OspC (B.b. afzelii + B.b. garinii + B.b. sensu stricto), DbpA (B.b. afzelii + B.b. garinii + B.b. sensu stricto).